因为靶点筛选实验都是高通量筛选，所以可能会有一定的假阳性结果，后续需要进行靶点验证实验，验证该蛋白是否与小分子存在直接相互作用。首先推荐SPR表面等离子共振技术，该技术是检测分子互作及亲和力的主流技术，也是目前唯一受到FDA认可的金标准技术，能够绘制出两种分析物相互作用的SPR分子互作动力学曲线，计算出KD稳态与平衡常数，说明小分子药物是否与靶蛋白直接结合。除此之外，也需要使用其他技术手段进行验证，比如pull down/DARTS/CETSA+WB等，通过多个实验确认证实小分子和靶点蛋白的相互作用。