小分子进行探针修饰后可能改变小分子的结构，从而影响其与靶蛋白的结合能力。探针的引入可能会带来空间位阻，或者改变分子的极性、溶解度等物理化学性质，进而影响活性。另外，修饰可能影响小分子的稳定性或细胞通透性，导致其在体外或体内的效果不同。因此，活性分析是为了确认修饰后的分子仍然保持原有的生物活性。

验证活性的方法可以参考原型小分子的功能性实验，进行酶活性抑制、细胞实验中的功能测试等。例如炎症研究方向，可以做一下标记后的产物对关键炎症因子的影响。